Это смотря по каким задачам проходит ваш ЦЗ. По 1 задаче (мат-тех. база) - если был ремонт - то всю документацию по ремонту (сметы, договора, доки по котировкам-аукционам, если они были, гос.контракт, платежки), обязательно проверят качество ремонта. Если оборудование закупали - тоже доки по закупкам (обоснование цен, котировки, конктракт)и использование закупленного в рамках модернизации оборудования (формуляры). По 3 задаче (6 мероприятие - доплаты по повышению доступности) смотрят ваше положение об условиях стимулирования (чтобы в приложениях был перечень персонала, получающего выплаты, расчет базового размера выплаты, методику оценки деятельности), приказ о создании комиссии, ежемесячные протоколы этой комиссии по распределению выплат + приказы по этим выплатам, доп. соглашения к труд. договору с работниками, получающими выплаты.
Да у каждой проверяющей конторы еще может быть свой взгляд на ведение документации)))))